02 · Warsztat
Zbuduj sekwencję
Wpisz nić górną, a nić komplementarna powstanie automatycznie według reguły parowania.
Najedź na kolumnę lub przejdź do niej klawiszem Tab i strzałkami — para podświetli się w modelu 3D.
Przykłady:
B-DNA · PRAWOSKRĘTNA
Dwie antyrównoległe nici owinięte wokół jednej osi, spięte parami zasad jak szczeblami skręconej drabiny. W formie B jeden pełny skręt obejmuje 10,5 pary.
Skróty działają po kliknięciu modelu lub nad nim: ← → obrót ↑ ↓ nachylenie + − powiększenie Spacja pauza R reset przeciągnij · kółko lub szczypnięcie: zoom
02 · Warsztat
Wpisz nić górną, a nić komplementarna powstanie automatycznie według reguły parowania.
Najedź na kolumnę lub przejdź do niej klawiszem Tab i strzałkami — para podświetli się w modelu 3D.
03 · Pomiary
Liczby zasad dotyczą nici górnej; w dupleksie A = T i G = C (reguła Chargaffa). Długość: liczba par × 0,34 nm. Temperatura topnienia z reguły Wallace’a to przybliżenie dla krótkich oligonukleotydów (ok. 14–20 nt) — dla dłuższych sekwencji wynik jest zawyżony.
04 · Legenda
puryna · dwa pierścienie
Paruje z tyminą przez 2 wiązania wodorowe.
pirymidyna · jeden pierścień
Paruje z adeniną przez 2 wiązania wodorowe. W RNA zastępuje ją uracyl.
puryna · dwa pierścienie
Paruje z cytozyną przez 3 wiązania wodorowe.
pirymidyna · jeden pierścień
Paruje z guaniną przez 3 wiązania wodorowe.
Reguła parowania: puryna zawsze łączy się z pirymidyną — A z T, G z C. Dzięki temu każda para ma niemal tę samą długość (odległość C1′–C1′ ok. 1,05 nm), a helisa zachowuje stałą średnicę około 2 nm.